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加載中

時空組學

高通量測序技術助力
時空組學的研究與應用

Applications

隨著生命科學研究的日益深入，傳統的單細胞測序技術已難以滿足對深層次、多維度生命系統探索的需求。時空組學技術應運而生，成為細胞研究領域的新星，它融合時間與空間維度，精準捕捉細胞基因表達及其在組織中的動態交互，革新了我們對生命奧秘的理解。

華大作為生命科學前沿技術的主要推動者，在2020年年初發布了自主研發的時空組學技術Stereo-seq（Spatial Enhanced Resolution Omics-Sequencing），該技術憑借高分辨、大視場、多組學、全物種的優勢，已成功應用于胚胎發育、疾病病理、腫瘤學、腦科學、植物科學等領域，助力科研人員在Cell、Science、Nature等國際頂級期刊上發表了多項科研成果。

時空組學

時空組學產品方案

產品方案對比

時空轉錄組FF產品方案（V1.3）

時空轉錄組FF V1.3 兼容mIF產品方案

時空轉錄組FFPE產品方案

時空轉錄組大尺寸芯片產品方案

時空蛋白轉錄組Stereo-CITE產品方案 V1.1

產品方案對比

類別時空轉錄組時空多組學
產品方案時空轉錄FF時空轉錄組FFPE時空轉錄組大尺寸芯片時空蛋白轉錄組Stereo-CITE
捕獲原理樣本類型Poly-A 捕獲隨機探針捕獲Poly-A 捕獲Poly-A 捕獲
檢測組學信息RNARNARNARNA+蛋白

檢測樣本類型

Fresh FrozenFFPEFresh FrozenFresh Frozen

兼容染色方案

SSDNA染色、

H&E染色、

mIF染色(適用于1cm x 1cm)

ssDNA染色、

H&E染色

ssDNA染色、

H&E染色

DAPI染色
捕獲面積

0.5 cm x 0.5 cm、

1 cm x 1 cm

1 cm x 1 cm

1 cm x 2 cm、

2 cm x 2cm、

2 cm x 3 cm可定制尺寸，最大到13 cm x 13 cm

1 cm x 1 cm
檢測物種類型不限物種不限物種不限物種人、小鼠
擴展應用

轉錄組兼容組織形態學；

轉錄組兼容低通量蛋自檢測；

空間單細胞分析

轉錄組兼容組織形態學；

微生物共檢測；

非編碼RNA共捕獲；

空間單細胞分析

定制化尺寸、

空間單細胞分析

轉錄組兼容高通量蛋白檢測
分析軟件版本SAW v8.1、StereoMap v4.1SAW v8.1、StereoMap v4.1SAW v8.1、StereoMap v4.1

SAW v8.1、StereoMap v4.1

Stereo-seq時空組學技術

時空組學技術Stereo-seq（SpaTial Enhanced REsolution Omics-sequencing），基于DNA納米球（DNA Nano Ball，DNB）開發，是具有高通量、超高分辨率、大視場的原位全景式技術，可以實現同一樣本在組織、細胞、亞細胞、分子“四尺度”同時進行空間轉錄組分析。該技術通過時空芯片捕獲組織中的 mRNA，并通過時空條形碼（Coordinate ID，CID）還原回空間位置，實現組織中基因空間表達檢測，為深入地了解細胞的基因表達及形態與局部環境之間的關系建立強大的研究基礎。

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