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助力多組學的研究與應用
CycloneSEQ? 測序技術是華大的納米孔測序技術,在測序過程中,基于該平臺進行測序時,DNA 文庫在馬達蛋白的引導下以單鏈形式依次通過嵌合在膜上的納米孔道蛋白。當不同的堿基穿過納米孔時,會引發納米孔中離子電流的變化。這些變化的電信號被通道傳感器檢測,再通過專用堿基識別算法進行解析,從而實現實時且準確地獲取DNA鏈上堿基的排列順序。
CycloneSEQ? 測序技術與DNBSEQ? 測序技術在測序長度和測序精度方面可以完美配合,在基因組組裝、基因組結構變異檢測和轉錄組研究等應用場景中,可實現更完整、更精準的分析:
● 基因組組裝:短讀長測序技術提供高覆蓋度和準確性,長讀長測序提供連續長序列段,兩者結合可以組裝出高質量的基因組序列。
● 基因組結構變異檢測:短讀長測序提供準確的SNP和INDEL檢測,長讀長測序直接檢測復雜結構變異,可以獲得更準確的基因組信息。
● 轉錄組研究:短讀長測序進行定量表達分析,長讀長測序獲得全長轉錄本序列,獲得更豐富的轉錄本信息。
WT-02
核心蛋白
在從馬里亞納海溝等極端環境中收集樣本的5億多條深海宏基因組數據庫中,分析發現深海中基因操作相關蛋白豐度高,具有更多結構多樣性。其中有一種高魯棒性的核酸操縱蛋白,它的核心功能區域結構顯著不同于大多數已知的馬達蛋白結構,解旋能力更強,并且它是熱液區來源,熱穩定性高;另一種是由同源多聚體自組裝形成的結構致密的孔蛋白,蛋白結構剛性強,測序噪聲小質量高,孔徑小。經過蛋白工程的設計改造,馬達蛋白更加具有測序速度快,穩定性強,持久續測的特點,孔道蛋白具有強捕獲,高穩定,持久續測,信噪比高的特點,這些蛋白構成了CycloneSEQ? 的核心蛋白基礎。
核心芯片
單芯片的納米孔傳感器采用高密度陣列式排布。傳感器微腔直徑及間距被精細優化,膜孔最佳適配,實現超低測序噪聲。微腔體積拓展,可實現超長測序時長。生物微機電系統(BioMEMS)與專用集成電路(ASIC)一體化集成,具備皮安級電流精準檢測能力,實時、穩定讀取核酸序列信息。
核心算法
結合ASR(自動語音識別)領域 SOTA 方案的測序解碼算法,通過海量數據訓練的深度神經網絡,在所有可能的組合中找到最優序列并精準解碼,自主開發出的 basecall 算法模型。該算法模型基于海量數據,大規模分布式訓練,模型準確率高達97%,且可以滿足多張芯片實時測序解碼,性能強勁。
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